关于“适应雨林”与“古人类混血”，在“东南亚人群基因组计划”中有相关重要发现：适应雨林：东南亚的热带雨林环境复杂，如高湿度、高温度、病原体暴露和密集的森林生态系统等，促使当地人群产生了多种适应性进化。研究团队采用CMS评分方法，在东南亚人群基因组中鉴定到44个受到强烈正选择的区域，涵盖89个基因，其中72个为首次发现的正选择靶点。这些基因涉及体质、免疫、代谢等适应性特征，揭示了东南亚人群应对热带环境的独特进化策略。例如，SLC245基因通过调控皮肤色素沉着抵御热带地区的强紫外环境，CDC42SE2可以减轻热带雨林地区蚊虫叮咬反应，MRPS22基因促成的卷发表型可加速散热等。古人类混血：研究表明，东南亚人群中存在多种丹尼索瓦人渗入模式。除了之前报道的东亚人群的两次渗入事件，首次在东南亚土著人群中发现了第3次基因渗入。这表明丹尼索瓦人可能在旧石器时代亚洲东部地区广泛分布，并且在东南亚大陆与现代人可能发生了多次的混血。同时，研究还鉴定出多个具有正向选择信号的古人类基因片段，涉及代谢调节、免疫增强及肌肉发育等关键功能，提示来自古人类的基因序列很可能对东南亚人群适应热带雨林环境产生了重要贡献。
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